Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata4Q08369 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata4Q08369 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata4Q08369 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms