Protein–RNA interactions for Protein: Q05685

Folr2, Folate receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr2Q05685 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Folr2Q05685 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Folr2Q05685 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms