Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox10Q04888 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox10Q04888 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox10Q04888 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox10Q04888 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox10Q04888 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms