Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddr1Q03146 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddr1Q03146 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddr1Q03146 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms