Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uba1Q02053 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uba1Q02053 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms