Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ldb1P70662 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb1P70662 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms