Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdrg1P59048 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdrg1P59048 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdrg1P59048 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms