Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sssca1P56873 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sssca1P56873 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms