Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pex2P55098 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pex2P55098 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pex2P55098 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pex2P55098 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pex2P55098 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pex2P55098 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms