Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad23aP54726 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad23aP54726 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad23aP54726 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms