Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cav1P49817 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cav1P49817 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cav1P49817 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms