Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms