Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP1P48552 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP1P48552 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms