Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VdrP48281 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VdrP48281 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VdrP48281 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VdrP48281 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VdrP48281 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VdrP48281 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VdrP48281 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VdrP48281 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VdrP48281 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VdrP48281 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VdrP48281 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VdrP48281 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VdrP48281 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VdrP48281 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VdrP48281 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VdrP48281 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VdrP48281 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VdrP48281 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VdrP48281 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VdrP48281 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VdrP48281 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VdrP48281 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VdrP48281 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VdrP48281 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms