Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mmp9P41245 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mmp9P41245 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mmp9P41245 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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