Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hes1P35428 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hes1P35428 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hes1P35428 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms