Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Apoc1P34928 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoc1P34928 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms