Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col2a1P28481 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col2a1P28481 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col2a1P28481 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms