Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afxP27661 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afxP27661 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms