Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctla2aP12399 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctla2aP12399 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctla2aP12399 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms