Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna4P07351 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna4P07351 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms