Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XlrP05531 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XlrP05531 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XlrP05531 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XlrP05531 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XlrP05531 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XlrP05531 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
XlrP05531 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
XlrP05531 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XlrP05531 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XlrP05531 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
XlrP05531 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
XlrP05531 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XlrP05531 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XlrP05531 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XlrP05531 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
XlrP05531 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XlrP05531 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XlrP05531 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XlrP05531 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XlrP05531 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XlrP05531 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XlrP05531 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms