Protein–RNA interactions for Protein: P01792

Ig heavy chain V region HPCG8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01792 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01792 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01792 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01792 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01792 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01792 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01792 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01792 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01792 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01792 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01792 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01792 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01792 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms