Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01728 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01728 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01728 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01728 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01728 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01728 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01728 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01728 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01728 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01728 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01728 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01728 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms