Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01649 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01649 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01649 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01649 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01649 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01649 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01649 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01649 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01649 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01649 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01649 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01649 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms