Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HcrtO55241 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HcrtO55241 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HcrtO55241 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HcrtO55241 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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