Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brs3O54798 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brs3O54798 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brs3O54798 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms