Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EdaO54693 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EdaO54693 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EdaO54693 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EdaO54693 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EdaO54693 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EdaO54693 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EdaO54693 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EdaO54693 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EdaO54693 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EdaO54693 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EdaO54693 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EdaO54693 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EdaO54693 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EdaO54693 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EdaO54693 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EdaO54693 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EdaO54693 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms