Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppef2O35385 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppef2O35385 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppef2O35385 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 408.7 ms