Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcshO08795 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcshO08795 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms