Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21887J3QQ04 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms