Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccer2J3QPU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccer2J3QPU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccer2J3QPU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms