Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r39G3UWE6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms