Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3072F6SKY8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms