Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngap1F6SEU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngap1F6SEU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms