Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm340F6RGI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm340F6RGI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms