Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrdnE9Q9K5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrdnE9Q9K5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms