Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms