Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf217D3YYI7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf217D3YYI7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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