Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmf1B9EKI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tmf1B9EKI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmf1B9EKI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms