Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2A3KGV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf2A3KGV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms