Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Palm3A2TJV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Palm3A2TJV2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms