Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fbxo47A2A6H3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo47A2A6H3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo47A2A6H3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms