Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28919A0A087WP35 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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