Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv4A0A075B5I2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv4A0A075B5I2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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