Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CartptP56388 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CartptP56388 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms