Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtpreP49446 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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