Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01654 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01654 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01654 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01654 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01654 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01654 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01654 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01654 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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