Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm21976J3QNN2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms