Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms