Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMPD4Q14CM0 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms